Les habitants du sud-est asiatique maritime sont majoritairement d’origine austronésienne.
Il n'est pas possible de dresser une liste exhaustive des ethnies minoritaires de la région tant elles sont nombreuses. La myriade d'îles, le relief montagneux ou les forêts difficilement pénétrables en ont maintenu le cloisonnement. Elles se comptent encore par centaines. (plus de 300 dans la seule Papouasie )
La dominante maritime de la région pourrait laisser à penser que les peuples sont essentiellement des marins, mais si la région compte dans ses populations parmi les meilleurs et les plus anciens navigateurs du monde, les Bugis ou les Bajo, la majorité sont des agriculteurs ne regardant la mer qu'avec crainte.
La population de l’Asie du Sud-Est maritime est classable en quatre groupes ethniques principaux :
Les Mélanésiens sont subdivisés pour n’en citer que quelques-uns, en :
Pour la seule Indonésie, 45 % de la population est javanaise, 14 % sundanaise, 7,5 % maduraise, 7,5 % malais côtiers et 26 % autres.
Les peuples autochtones d’Asie du Sud-Est maritime sont majoritairement de type mélanésien et sont qualifiés couramment, de Malais ou d’Indonésiens, mais ils se trouvent également sur les îles voisines des Philippines, dans la péninsule malaisienne et même aussi loin que Taiwan et Madagascar. Ils et se caractérisent par une petite taille, une pigmentation claire à brun foncé, des cheveux noirs épais et lisses, une tête large, un nez large et des lèvres épaisses.
A partir de l'est de Flores, dans les îles de la sonde occidentale, apparaissent des métissages avec des peuples de type Papou. Ils ont des traits négroïdes, résultat de mariages mixtes avec les Papous de Nouvelle-Guinée .
Des Chinois de souche, forment une des principale minorité, active principalement dans les affaires dans les grandes villes. Ils sont relativement prospères et très mal accueillis par les habitants de souche. Ils ont été périodiquement la cible d'émeutes ( 1974, 1980 et 1998).